IMPLEMENTASI ALGORITMA SMITH-WATERMAN PADA LOCAL ALIGNMENT DALAM PENCARIAN KESAMAAN PENSEJAJARAN BARISAN DNA (STUDI KASUS: DNA TUMOR WILMS)

Ernawati, Ernawati and Diyah , Puspitaningrum and Ambar , Pravitasari (2015) IMPLEMENTASI ALGORITMA SMITH-WATERMAN PADA LOCAL ALIGNMENT DALAM PENCARIAN KESAMAAN PENSEJAJARAN BARISAN DNA (STUDI KASUS: DNA TUMOR WILMS). PSEUDOCODE, 1 (2). pp. 170-177. ISSN 2355-5920

Archive (Article) JurnalPseudocode_Sept2014_SmithWatermanDNA_AmbarPravitasari.pdf - Bibliography Restricted to Registered users only Available under License Creative Commons GNU GPL (Software). Download (9MB)

Abstract

Pencarian kesamaan pensejajaran barisan DNA dengan menggunakan algoritma Smith-Waterman pada local alignment ini digunakan untuk mencari persentase kesamaan yang dihasilkan untuk mengetahui tingkat kesamaan pensejajaran 2 buah sekuen. DNA merupakan suatu makro molekul yang tersusun oleh nukleotida sebagai molekul dasar yang membawa sifat gen. Aplikasi pencarian kesamaan pensejajaran barisan DNA ini diharapkan dapat memberikan kemudahan dalam melakukan pensejajaran 2 buah sekuen sehingga menampilkan tingkat kemiripan dari kedua sekuen DNA tersebut. Pada penelitian ini sebagai masukannya menggunakan string barisan DNA yang diperoleh dari National Center for Biotechnology Information (www.ncbi.nlm.nih.gov) yang memiliki keluaran berupa persentase kesamaan serta lamanya waktu proses dijalankan.

Actions (login required)

View Item