IDENTIFIKASI MUTASI GEN BMPR1B PADA DOMBA MEGA MENGGUNAKAN METODE PCR-RFLP

Domba merupakan salah satu komoditas ternak penghasil daging yang tersebar di
seluruh Indonesia. Data produksi daging domba menurut badan statistik nasional (2021), di
tahun 2018, 2019 dan 2020 masing-masing mencapai angka 82.274,38 ton, 70.072,93 ton
dan 66.943,34 ton. Kecenderungan penurunan produksi daging domba dalam tiga tahun
terakhir ini merupakan masalah yang serius untuk ditanggulangi dengan baik. Salah satu
penanggulangannya yaitu dengan melakukan seleksi ternak secara molekuler. Metode ini
menyeleksi individu domba yang membawa sifat dominan yang baik terhadap sifat
reproduksi. Sifat reproduksi pada domba salah satunya dipengaruhi oleh gen BMPR1B
yaitu gen yang berpengaruh terhadap tingkat litter size domba. Adapun keragaman genetik
pada gen BMPR1B dapat dideteksi dengan menggunakan metode PCR-RFLP.
Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi ada atau tidaknya mutasi gen
BMPR1B pada domba Mega. Pelaksanaan penelitian dilakukan dari bulan April sampai
Agustus 2021 di laboratorium Genetika Molekuler Hewan Pusat Penelitian Bioteknologi�BRIN Cibinong, Jl. Raya Bogor KM 46, Bogor, Jawa Barat. Sampel DNA yang digunakan
merupakan dari domba Mega (75% Merino × 25% Garut) yang dikembangkan di
Bioteknologi-BRIN. Total sampel yang digunakan dalam penelitian ini berjumlah 54
sampel. Metode penelitian ini memanfaatkan PCR-RFLP, mutasi gen BMPR1B dapat
dideteksi menggunakan enzim AvaII dengan target sekuens 140 bp. Analisis data pada
penelitian ini berjumlah tiga variabel, pertama frekuensi alel, kedua frekuensi genotip, nilai
heterozigositas dan terakhir nilai PIC (polymorphic information content).
Berdasarkan hasil penelitian ini diketahui bahwa terdapat carrier alel mutan B pada
gen BMPR1B domba Mega dengan frekuensi sebesar 0,13. Genotip mutan homozigot BB
tidak ditemukan pada domba Mega yang diteliti. Gen BMPR1B pada domba Mega
memiliki dua tipe genotip yaitu B+ (0,259) dan ++ (0,741). Pada keseimbangan
heterozigositas telah mengalami perubahan atau He tidak sama dengan Ho karena telah
dilakukan seleksi pada domba Mega. Nilai PIC pada gen BMPR1B domba Mega sebesar
0,20 (rendah) yang menandakan bahwa keragaman genetik pada gen BMPR1B domba
Mega termasuk rendah.