ANALISIS KEKERABATAN CODOT KRAWAR Cynopterus brachyotis (Muller, 1838) POPULASI BENGKULU BERDASARKAN GEN COI DNA MITOKONDRIA

Codot Krawar Cynopterus brachyotis (Muller, 1838) merupakan salah satu
spesies dari ordo Chiroptera yang dapat ditemukan di kawasan kampus Universitas
Bengkulu. Spesies ini memiliki kemiripan yang tinggi secara morfologi dengan
spesies lain dalam genus Cynopterus. Identifikasi secara molekuler menggunakan
gen COI DNA mitokondria dapat mengungkap validitas identifikasi spesies.
Penelitian ini dilakukan dengan tujuan memverifikasi identitas spesies C.
brachyotis, mengkarakterisasi sekuen parsial serta melakukan analisis kekerabatan
intraspesies dan interspesies Codot Krawar C. brachyotis asal Bengkulu (kawasan
kampus Universitas Bengkulu) berdasarkan data sekuen gen COI. Sampel DNA
diisolasi dari jaringan hati 6 individu berbeda menggunakan gSYNCTM DNA
Extraction Kit Quick Protocol, diikuti amplifikasi sekuen DNA target
menggunakan teknik Polymerase Chain Reaction (PCR). Sampel yang sesuai
panjang target dikirim ke Apical Scientific Snd. Bhd untuk sequencing. Data sekuen
dianalisis dengan program MEGA 12, verifikasi spesies menggunakan BLASTn,
analisis kekerabatan dilakukan menggunakan metode Neighbor Joining (NJ).
Analisis filogenetik menunjukkan Codot Krawar C. brachyotis populasi Bengkulu
membentuk clade monofiletik dengan C. brachyotis asal Semenanjung Malaysia
dan Unknown (tidak diketahui) dengan dukungan boostrap 65 %. Jarak genetik rata�rata berkisar 0,00-1,16 %. Hasil ini mengonfirmasi identitas Codot Krawar C.
brachyotis asal Bengkulu dan menunjukkan kedekatan kekerabatan dengan
populasi dari Semenanjung Malaysia.
Kata Kunci: Chiroptera, COI, Codot Krawar Cynopterus brachyotis, DNA
Mitokondria, Kelelawar