ANALISIS GEN CYTOCHROME B DNA MITOKONDRIA PADA CODOT KRAWAR Cynopterus brachyotis (Muller, 1838) ASAL BENGKULU

Cynopterus brachyotis merupakan salah satu jenis kelelawar yang
termasuk kelompok Megachiroptera yang dikenal sebagai kelelawar pemakan
buah. Kelelawar ini dapat ditemukan di pohon-pohon yang tersedia sumber
makanannya, termasuk di kawasan kampus Universitas Bengkulu. Berdasarkan
database yang terdapat dalam GenBank, belum tersedia data molekuler mengenai
gen Cytochrome b terkait C. brachyotis yang berasal dari Bengkulu. Oleh karena
itu, penelitian ini dilakukan dengan tujuan memverifikasi identitas spesies C.
brachyotis, mengkarakterisasi sekuen parsial serta menghitung jarak genetik antar
spesies C. brachyotis populasi Bengkulu berdasarkan data sekuen gen
Cytochrome b. Sampel DNA diisolasi dari jaringan hati. DNA isolasi dari
jaringan hati menggunakan gSYNC TM DNA Extraction Kit Quick Protocol (For
Tissue Protocol Procedure), diikuti amplifikasi sekuen DNA target menggunakan
teknik Polymerase Chain Reaction (PCR). Proses sequencing produk PCR
dilakukan di PT Apical Scientific Sdn. Bhd. Data hasil sequensing di analisis
menggunakan program MEGA 12. Verifikasi identifikasi molekuler
menggunakan BLASTn menunjukkan bahwa sekuen C. brachyotis asal Bengkulu
memiliki tingkat kesamaan (Percent Identity) sebesar 98,73-99,01% dengan
memiliki nilai jarak genetik intrapopupasi C. brachyotis asal Bengkulu berkisar
antara 0,00 – 1,00% sedangkan jarak genetik intraspesies memiliki nilai rata-rata
0,86-1,17%, interspesies dengan nilai rata-rata 9,75-10,87% dan outgroup dengan
rata-rata 18,83-19,91%. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa analisis
molekuler gen Cytochrome b, spesies C. brachyotis asal Bengkulu terkonfirmasi
sebagai C. brachyotis dengan variasi genetik, Sehingga memiliki upaya
konservasi kelelawar pada populasi Bengkulu.
Kata Kunci: Cynopterus brachyotis, Cytochrome b, DNA Mitokondria, PCR