ANALISIS KEKERABATAN BARONG SEDANG Hipposideros larvatus (Horsfield, 1823) POPULASI BENGKULU BERDASARKAN GEN CYTOCHROME B DNA MITOKONDRIA

Hipposideros larvatus merupakan kelelawar penghuni gua yang termasuk
kedalam kelompok kelelawar pemakan serangga. Kelelawar ini ditemukan sebagai
salah satu penghuni gua yang ada di Bengkulu yaitu Gua Pemetung Bengkulu Utara
dan Gua Suruman Bengkulu Selatan. Berdasarkan Genbank terdapat 199 data
sekuen gen Cytochrome b, namun belum ada data sekuen asal Bengkulu. Penelitian
ini bertujuan untuk menganalisis hubungan kekerabatan intraspesies dan
interspesies kelelawar H. larvatus populasi Bengkulu melalui rekonstruksi pohon
filogenetik dan mengkarakterisasi sekuen gen Cytochrome b DNA mitokondria
spesies tersebut. Sampel DNA diisolasi dari jaringan hati menggunakan gSYNCTM
DNA Extraction Kit dengan gSYNCTM DNA Extraction Kit Quick Protocol (For
Tissue Protocol Procedure). Replikasi DNA target (±771 pb) pada gen Cytochrome
b dilakukan melalui proses amplifikasi menggunakan teknik Polymerase Chain
Reaction (PCR) dengan primer spesifik. Sequencing produk PCR dilakukan di PT.
Apical Scientific Sdn. Bhd. Analisis kekerabatan berdasarkan jarak genetik dan
rekontruksi pohon filogenetik menggunakan gen Cytochrome b sepanjang 778 pb
menunjukkan bahwa H. larvatus populasi Bengkulu membentuk monofiletik
dengan H. cf larvatus dari Siberut, Thailand, dan Vietnam serta H. larvatus
Malaysia dan China dengan dukungan boostrap 98%. Kekerabatan terdekat dengan
populasi asal Siberut dengan jarak genetik rata-rata 2,27%. Hasil penelitian secara
keseluruhan menunjukkan bahwa H. larvatus populasi Bengkulu menunjukkan
kemiripan genetik dengan populasi Asia yang mencerminkan kestabilan genetik
yang relatif dalam spesies tersebut.
Kata Kunci : Cytochrome b, DNA Mitokondria, filogenetik, Hipposideros larvatus